Systematic identification of key functional modules and genes in esophageal cancer

نویسندگان

چکیده

Abstract Background Esophageal cancer is associated with high incidence and mortality worldwide. Differential expression genes (DEGs) weighted gene co-expression network analysis (WGCNA) are important methods to screen the core as bioinformatics methods. Methods The DEGs WGCNA were combined hub genes, pathway enrichment analyses performed on module in WGCNA. CCNB1 was identified based intersection between greenyellow Expression levels prognostic values of verified UALCAN, GEPIA2, HCMDB, Kaplan–Meier plotter, TIMER databases. Results We 1,044 from dataset GSE20347, 1,904 GSE29001, 2,722 GSE111044, 32 modules revealed by gene, which upregulated tumour tissues. Moreover, esophageal patients higher showed a worse prognosis. However, ‘might not play an role immune cell infiltration. Conclusions Based key related cancer, offered novel insights into development treatment cancer.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

dedekind modules and dimension of modules

در این پایان نامه، در ابتدا برای مدول ها روی دامنه های پروفر شرایط معادل به دست آورده ایم و خواصی از ددکیند مدول ها روی دامنه های پروفر مشخص کرده ایم. در ادامه برای ددکیند مدول های با تولید متناهی روی حلقه های به طور صحیح بسته شرایط معادل به دست آورده ایم و ددکیند مدول های ضربی را مشخص کرده ایم. گزاره هایی در مورد بعد ددکیند مدول ها بیان کرده ایم. در پایان، قضایای lying over و going down را برا...

15 صفحه اول

Identification of the Key Genes and Pathways in Esophageal Carcinoma

Objective. Esophageal carcinoma (EC) is a frequently common malignancy of gastrointestinal cancer in the world. This study aims to screen key genes and pathways in EC and elucidate the mechanism of it. Methods. 5 microarray datasets of EC were downloaded from Gene Expression Omnibus. Differentially expressed genes (DEGs) were screened by bioinformatics analysis. Gene Ontology (GO) enrichment, K...

متن کامل

functional study of p0 proteins of two cereal yellow dwarf viruses (cydv-rpv and cydv-rps) and identification of their cellular partner

نقش سرکوبگری پروتئین p0 در دو پولروویروس کوتولگی زردی غلات cydv-rpv) و (cydv-rps، متفاوت در شدت بیماریزایی، مورد مطالعه قرار گرفت. نتایج نشان داد که هر دو پروتئین p0 p0cy-rpv) و (p0cy-rps قادر به سرکوب خاموشی آر ان ای ایجاد شده توسط ترادف های تراژن سنس و تکرار معکوس در n. benthamiana هستند. نشان داده شد که هر دو پروتئین p0 می توانند تخریب پروتئین argonaute-1 را تسهیل کنند. علاوه بر این، تمایل م...

Systematic tracking of dysregulated modules identifies novel genes in cancer

MOTIVATION Deciphering the modus operandi of dysregulated cellular mechanisms in cancer is critical to implicate novel cancer genes and develop effective anti-cancer therapies. Fundamental to this is meticulous tracking of the behavior of core modules, including complexes and pathways across specific conditions in cancer. RESULTS Here, we performed a straightforward yet systematic identificat...

متن کامل

Identification of key genes in melanoma metastasis and investigating their potential as biomarkers

Background and Aim: Considering the high global incidence of skin cancer and the high mortality rate caused by melanoma, it is important to identify the genes involved in this disease and predict effective drugs. Therefore, in this study, we have identified and investigated the expression level of effective and key genes in melanoma metastasis, as well as investigating their diagnostic potentia...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: Cancer Cell International

سال: 2021

ISSN: ['1475-2867']

DOI: https://doi.org/10.1186/s12935-021-01826-x